Почитайте в этой статье:
В данной статье мы рассмотрим особенности импорта в Altium Designer проектов, выполненных в системе P-CAD, что позволит проектировщикам оптимально преобразовать "пикадовский" проект с учетом переноса данных в различных слоях. http://esg.spb.ru/articles/105
Или здесь - Конверсия данных при переходе с P-CAD 200x на Altium Designer http://esg.spb.ru/articles/84
Им, в принципе, можно и письмо написать в техподдержку с вопросом.
В Альтиуме не допускаются перестановки компонентов. Допустимы только перестановки логических секций (вентилей) в пределах одной микросхемы или сборки резисторов, коденсаторов и т.п., и только в том случае, если такой компонент изображен разнесенным способом. Допустимы, конечно, перестановки логически эквивалентных выводов в пределах одного компонента. Рассказывать это долго. Читайте документ ХЕЛПа AR0138 Pin and Part Swapping with Dynamic Net Assignment.pdf
Перестановка компонентов Maroon [13.02.14 16:37]
еще здесь Maroon [13.02.14 16:50]